En este departamento se coordinan las actividades y proyectos que se desarrollan de manera permanente en el Centro de Ciencias de la Atmósfera de la UNAM. Entre los proyectos institucionales que se coordinan, con una amplia colaboración interinstitucional, destacan la Red Universitaria de Observatorios Atmosféricos (RUOA), la Unidad de Informática para las Ciencias Atmosférica y Ambientales (UNIATMOS) y el Programa de Estaciones Meteorológicas del Bachillerato Universitario (PEMBU).