El taller mecánico se encarga del diseño, construcción e innovación de equipos y partes mecánicas para ser utilizadas en las diversas campañas de medición que llevan a cabo los grupos experimentales que conforman el Centro siendo parte primordial para esas campañas.
Por otra parte se dan asesorías a los diversos grupos que conforman el centro en lo referente a la instrumentación que se utiliza en los proyectos que van a realizar.
Se forma personal mediante los programas de servicio social, prácticas profesionales y estancias profesionales de diversas instituciones de educación como son Facultad de Ingeniería, Instituto Tecnológico de Cuautla, otorgándoles capacitación en la utilización, manejo de máquinas y herramientas de corte y desbaste.